在西滨国中有个不可思议的传说，就是每三年一定会出现一个“小夜子”，而小夜子必须完成三项任务，否则全校师生将会遭遇不幸。　　小夜子的任务包括：在开学典礼的早上，将红花放在玄关布告栏下；在文化祭演出名为“小夜子”的戏剧；在毕业典礼当天，偷偷把钥匙传给下一位小夜子。　　小夜子不可泄漏自己的身份，若能顺利完

进入正化年间（始自1989年），为了改善混乱堕落的社会风气，日本政府颁布《媒体良化法》，并成立特殊部门对所有可能影响世人身心健康的书籍进行查封与销毁。可与此同时，言论自由也遭到粗暴遏制和打压。为了捍卫自由思想，名为“图书馆自卫组织图书队”的组织应运而生，他们为了保护书籍拿起武器，许多人为此献出生命。

日本战国时代末期，各路诸侯连年征伐，战火不断，致令饿殍遍野，生灵涂炭。一代霸主丰臣秀吉死后，旧有的丰臣家族和德川家康发动了夺取天下的战争。为了有效摧毁对手，德川下令组建了武功高桥的杀手集团，在这些人中间，唯一的少女阿墨（上户彩 饰）正是其中的佼佼者。继加藤正清、浅野长政之后，真田昌幸（平干二朗 饰）

东京都知事遭到日本黑帮份子暗杀后，美国中情局决定号召前任探员崔维斯杭特（史蒂文·席格 饰）来调查本案。崔维斯在日本长大，而且曾受日本黑道的栽培。他利用他在日本的人脉，很快地发现老派与新派的黑帮份子之间正酝酿着一场斗争，年轻的一方与中国黑帮关系密切。崔维斯与老派黑帮份子站在同一阵线，赤手空拳地在日本大

自从《媒体良化法》推行以来，近未来的日本围绕风纪约束和言论自由展开了激烈的拉锯战。媒体良化队针对有害书籍的查禁和销毁不遗余力，与之相对，图书馆自卫组织图书队则拼尽全力保护着人们获取知识和娱乐的自由，为此不惜与良化队兵戎相见，牺牲生命。在历次的对抗中，倔强女孩笠原郁（荣仓奈奈 饰）和魔鬼教官堂上笃（冈